写在前面:
请参考之前的文章安装好CentOS、NVIDIA相关驱动及软件、docker及加速镜像。
主机运行环境
$ uname -a Linux CentOS 3.10.0-514.26.2.el7.x86_64 #1 SMP Tue Jul 4 15:04:05 UTC 2017 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux $ cat /usr/local/cuda/version.txt CUDA Version 8.0.61 $ cat /usr/local/cuda/include/cudnn.h | grep CUDNN_MAJOR -A 2 #define CUDNN_MAJOR 6 #define CUDNN_MINOR 0 #define CUDNN_PATCHLEVEL 21 #define CUDNN_VERSION (CUDNN_MAJOR * 1000 + CUDNN_MINOR * 100 + CUDNN_PATCHLEVEL) #include "driver_types.h" # NVIDIA 1080ti
一、关于GPU的挂载
1. 在docker运行时指定device挂载
先查看一下有哪些相关设备
$ ls -la /dev | grep nvidia crw-rw-rw- 1 root root 195, 0 Nov 15 13:41 nvidia0 crw-rw-rw- 1 root root 195, 1 Nov 15 13:41 nvidia1 crw-rw-rw- 1 root root 195, 255 Nov 15 13:41 nvidiactl crw-rw-rw- 1 root root 242, 0 Nov 15 13:41 nvidia-uvm crw-rw-rw- 1 root root 242, 1 Nov 15 13:41 nvidia-uvm-tools
电脑上装了两个显卡。我需要运行pytorch,dockerhub中pytorch官方镜像没有gpu支持,所以只能先pull一个anaconda镜像试试,后面可以编排成Dockerfile。
$ docker run -it -d --rm --name pytorch -v /home/qiyafei/pytorch:/mnt/home --privileged=true --device /dev/nvidia-uvm:/dev/nvidia-uvm --device /dev/nvidia1:/dev/nvidia1 --device /dev/nvidiactl:/dev/nvidiactl okwrtdsh/anaconda3 bash
okwrtdsh的镜像似乎是针对他们实验室GPU环境的,有点过大了,不过勉强运行一下还是可以的。在容器内部还需要
安装pytorch:
$ conda install pytorch torchvision -c pytorch
这里运行torch成功,但是加载显卡失败了,可能还是因为驱动不匹配的原因吧,需要重新安装驱动,暂时不做此尝试;
二、通过nvidia-docker在docker内使用显卡
详细信息:https://github.com/NVIDIA/nvidia-docker
(1)安装nvidia-docker
nvidia-docker其实是docker引擎的一个应用插件,专门面向NVIDIA GPU,因为docker引擎是不支持NVIDIA驱动的,安装插件后可以在用户层上直接使用cuda。具体看上图。这个图很形象,docker引擎的运行机制也表现出来了,就是在系统内核之上通过cgroup和namespace虚拟出一个容器OS的用户空间,我不清楚这是否运行在ring0上,但是cuda和应用确实可以使用了(虚拟化的问题,如果关心此类问题可以了解一些关于docker、kvm等等虚拟化的实现方式,目前是系统类比较火热的话题)
下载rpm包:https://github.com/NVIDIA/nvidia-docker/releases/download/v1.0.1/nvidia-docker-1.0.1-1.x86_64.rpm
这里也可以通过添加apt或者yum sourcelist的方式进行安装,但是我没有root权限,而且update容易引起docker重启,如果不是实验室的个人环境不推荐这么做,防止破坏别人正在运行的程序(之前公司一个小伙子就是在阿里云上进行了yum update,结果导致公司部分业务停了一个上午)。
$ sudo rpm -i nvidia-docker-1.0.1-1.x86_64.rpm && rm nvidia-docker-1.0.1-1.x86_64.rpm $ sudo systemctl start nvidia-docker
(2)容器测试
我们还需要NVIDIA官方提供的docker容器nvidia/cuda,里面已经编译安装了CUDA和CUDNN,或者直接run,缺少image的会自动pull。
$ docker pull nvidia/cuda $ nvidia-docker run --rm nvidia/cuda nvidia-smi
在容器内测试是可以成功使用nvidia显卡的:
(3)合适的镜像或者自制dockerfile
合适的镜像:这里推荐Floydhub的pytorch,注意对应的cuda和cudnn版本。
docker pull floydhub/pytorch:0.3.0-gpu.cuda8cudnn6-py3.22 nvidia-docker run -ti -d --rm floydhub/pytorch:0.3.0-gpu.cuda8cudnn6-py3.22 bash
三、关于一些bug
这里有部分debian的配置,我照着dockerhub上anaconda镜像抄的,这里就不再配置了,反正跑起来后有镜像也可以用。系统随后可能会出现错误:
kernel:unregister_netdevice: waiting for lo to become free. Usage count = 1
这个小哥给出了一个解决方案,至少他给出的错误原因我是相信的:是由内核的TCP套接字错误引发的。这里我给出一些思考,关于上面的结构图,在显卡上,通过nvidia-docker,docker之上的容器可以使用到底层显卡(驱动显然是在docker之下的),而TCP套接字,我猜测也是这种使用方法,而虚拟出来的dockerOS,应该是没有权限来访问宿主机内核的,至少内核限制了部分权限。这位小哥给出了测试内核,如果有兴趣可以去帮他测试一下:https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/linux/+bug/1711407/comments/46。
总结
以上所述是小编给大家介绍的docker挂载NVIDIA显卡运行pytorch的方法,希望对大家有所帮助,如果大家有任何疑问请给我留言,小编会及时回复大家的。在此也非常感谢大家对网站的支持!
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